Учените току-що обявиха откриването на ново, невероятно общ вирус, който живее вътре в човека чревни бактерии. Той получи името “crAssphage” и на почти шест пъти по-често срещани от всички други бактериални вируси взети заедно. Но как успяхме да не го забележим толкова много път?
снимка от открити източници
Причината, че не сме открили crAssphage преди, е защото че не знаехме, че трябва да го търсим. Така е средства.
Докато новите технологии за секвениране стават все повече и повече бързи и евтини, те все още имат една слабост: те добро за откриване на неща, за които вече знаем, че съществуват но те са лошо подходящи за търсене на нови организми. когато изследователите изучават органична проба, от която получават супа ДНК фрагменти от всички живи същества, свързани с това проба – бактерии, вируси и самият човек. Тогава тези фрагменти трябва да бъдат сглобени в последователността, която можем идентифицират. Ако намерим верига, специфична за генома някои бактерии – това означава, че открихме тази бактерия в пробата.
Проблемът е, че ако все още не знаем последователности на непознат за нас вирус – не можем открийте с помощта на тази техника. Но всъщност авторът на новото crAssphage изследвания Bas Datil съобщават, че те са почти неизвестни 75 процента от ДНК последователностите в изследваните проби.
Екипът на Datila успя да намери нов вирус, използвайки съвсем различен подход, базиран на проста идея: фрагменти, които след време се намират в една и съща проба, с голяма степен на вероятност са части от един геном. Те използваха техниката така наречен кръстосан монтаж за идентифициране на една такава група повтарящи се последователности в проби, взети от 12 души. Тогава те събрали тези последователности в един геном.
И те получиха точно това: вирус crAssphage, кръстен на него техника на кръстосано сглобяване, което доведе до неговото откритие. Те открили, че crAssphage живее вътре в Bacteroides – обща група бактерии, които живеят в червата ни.
В резултат на изследванията екипът намери crAssphage в 75% чревни последователности на хора в САЩ, Европа и Южна Корея. Ние сме докато не разберем какво точно правят тези фаги в червата ни, но те определено играят роля в нашия чревен микроб екосистема.
И накрая, интересен факт: учените са изчислили това в нашата тялото е около 100 пъти повече вирусни частици, отколкото всъщност човешки клетки. Така че имаме още много работа. разберете какви всъщност сме.
ДНК вируси
