Може би сте чували за Folding @ home, популярно приложение, което може да се стартира на компютър, за да помогне на изследователите да се справят с някои медицински проблеми, включително новия коронавирус.
Миналия месец мрежата от доброволци, които са я инсталирали, се е разраснала толкова много, че платформата надминава най-мощните суперкомпютри в света.
Според директора и биохимик на Folding @ home Грег Бауман, през последните седмици са се присъединили близо 700 000 нови оператори на Folding @ home. Това е огромен ръст от 30 000 души, които рутинно използват Folding @ home през цялото време.
И това също има огромно значение за изчислителната мощ – мрежата Folding @ home достигна изумителните 2,4 екзафлопа от изчислителна мощност по-рано тази седмица, което я направи по-бърза от 500-те най-добри суперкомпютъра в света, взети заедно.
Основната задача на Folding @ home е да моделира как се държат протеините в тялото, което е в основата на много основни биологични функции.
Тези функции включват вирусна инфекция: екипът на Folding @ home изучава по-специално как така нареченият „шип“ на вируса SARS-CoV-2 (който всъщност се състои от три протеина) се прикрепя към човешките клетки и заразява човешкото тяло.
Това е ключов начин новият коронавирус да навлезе в човешката тъкан, така че блокирането му може да бъде от решаващо значение за бъдещи лечения и ваксинации. Ако можем да разберем как работят протеиновите протеини – което правят компютърните симулации на Folding @ home – тогава можем по-добре да разработим лекарства, които да ги спрат.
Върхът на протеина SARS-CoV-2 в действие. (Сгъване @ home / YouTube)
„Ако се опитате да симулирате такъв процес на домашния си компютър, бихте имали късмета да видите дори част от процеса през следващите 100 години“, пише Боуман в блога Folding @ home. “За щастие имаме подкрепления!”
Магията на Folding @ home е, че системата разбива сложните компютърни симулации на протеиново поведение на по-малки задачи, които след това могат да бъдат разпределени между хиляди компютри по целия свят – всеки взема по парче.
Folding @ home реализира и много други проекти, свързани с коронавируса: обработва данни, за да оцени ефективността на потенциалните лекарства, които сега се тестват в лаборатории и да анализира как коронавирусът контролира клетъчния механизъм след инфекция.
